課程資訊
課程名稱
生物資訊學
BIOINFORMATIC 
開課學期
95-2 
授課對象
生命科學院  生命科學系  
授課教師
阮雪芬 
課號
LS3005 
課程識別碼
B01 31050 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
必修 
上課時間
星期二5,6(12:20~14:10) 
上課地點
生科4A 
備註
B群選擇必修。最好曾修過分子生物學或生物化學與林仲彥合開
限學士班三年級以上
總人數上限:50人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/952bi 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程主在介紹現今在生物資訊
領域的相關知識. 課程內容包
括: Introduction, Biological
Databases, Analysis at the
Nucleotide and Protein
Level, Inferring
Relationships等 

課程目標
希望訓練學生利用生物資訊工具
及知識進行其它課程的資料收集
及分析 
課程要求
先行修過生物化學或分子生物學
或基因體 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 
指定閱讀
 
參考書目
1. Bioinformatics: A practical guide to the analysis of
genes and proteins (2005), Andreas D. Baxevanis and B. F.
Francis Ouellette, Wiley-Liss (藝軒)
2. 國外最新的期刊 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
期中報告 
40% 
 
2. 
期末報告 
40% 
 
3. 
平時作業及表現 
20% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/27  Introduction (阮雪芬) 
第2週
3/06  Biological Databases I: Sequence Databases (阮雪芬) 
第3週
3/13  Biological Databases II: Mapping Databases (阮雪芬) 
第4週
3/20  Biological Databases III: Information Retrieval from Biological Databases (阮雪芬) 
第5週
3/27  Systems Biology and Bioinformatics Symposium 2007 (SBBS07) 
第6週
4/03  Genomics Databases & Analysis at the Nucleotide Level I: Predictive Methods Using DNA Sequences (阮雪芬) 
第7週
4/10  Analysis at the Nucleotide Level II: Predictive Methods Using RNA Sequences (阮雪芬) 
第8週
4/17  期中考週 
第9週
4/24  Analysis at the Nucleotide Level III: Sequence Polymorphisms (阮雪芬) 
第10週
5/01  Analysis at the Protein Level I: Predictive Methods Using Protein Sequences (林仲彥) 
第11週
5/08  Analysis at the Protein Level II: Protein Structure Prediction and Analysis (林仲彥) 
第12週
5/15  Analysis at the Protein Level III: Intermolecular Interactions and Biological Pathways (林仲彥) 
第13週
5/22  Inferring Relationships I: Assessing Pairwise Sequence Similarity: BLAST and FASTA (林仲彥) 
第14週
5/29  Inferring Relationships II & III: Creation and Analysis of Multiple Sequence Alignment and Phylogenetic Analysis(林仲彥) 
第15週
6/05  Inferring Relationships IV : Using DNA Microarrays to Assay Gene Expression: (林仲彥) 
第16週
6/12  Inferring Relationships V: Proteomics and Protein Identification (林仲彥) 
第17週
6/19  端午節(放假一天) 
第18週
6/26  期末考週